In the two rakaat sunnats of Fajr, it is sunnah for one to recite Surah Kaafiroon in the first rakaat and Surah Ikhlaas in the second rakaat:
عن أبي هريرة رضي الله عنه أن رسول الله صلى الله عليه وسلم قرأ في ركعتي الفجر: قل يا أيها الكافرون، وقل هو الله أحد. (مسلم رقم 726)
Hazrat Abu Hurayrah (Radhiyallahu Anhu) reports that Rasulullah (Sallallahu Alaihi Wasallam) would recite Surah Kaafiroon and Surah Ikhlaas in the two rakaat (sunnats) of Fajr.
Source: Ihyaauddeen.co.za